Nach Kulturen, welche hohe N-Restmengen hinterlassen, sollten Kulturen folgen, die eine hohe Biomassebildung vor dem Winter haben, da diese die N-Verlagerungen über den Winter verringern. Die regional übliche Fruchtfolge der Winterungen (Wintergerste-Winterraps-Winterweizen) sollte daher aus der Sicht des Gewässerschutzes überdacht werden. Zwischenfrüchte vor Sommerungen vermindern die N-Verlagerung über den Winter, daher ist es sehr empfehlenswert, Zwischenfrüchte einzusetzen. Vor Anbau von Sommergetreide sollten jedoch die standörtlichen Gegebenheiten geprüft werden, um zu geringe Erträge vorzubeugen. Die hydrogeologischen Untersuchungen zeichnen im Projektverlauf (noch) kein aussagekräftiges Bild bezüglich reduzierter Nitrateinträge aufgrund der Fruchtfolgeumstellung.  Wichtig ist aber die Erkenntnis, dass unbeeinflussbare Randbedingungen (z.B. Witterung) unvermeidbare N-Verluste zur Folge haben können: Starkregenereignisse können auch außerhalb der Sickerwasserperiode zur Grundwasserneubildung und N-Auswaschung führen.