project - EIP-AGRI Operational Group
GENORIP - Development of a genomic tool for the managment of reproduction and inbreeding control in dairy cattle
GENORIP - Sviluppo di uno strumento genomico per la gestione della riproduzione nei bovini da latte e per il controllo della consanguineità
Objectives
Development of a herd reproduction management tool based on genomic information and free to use for the farming community. The tool plans to release information for the control of the level of genomic inbreeding, the management of genetic variability and suggests matings with selected sires based on genomic information. The tool will be complementary to the existing ones and modular with respect to future tools that can integrate it. Dissemination of results to farmers through demonstration and dissemination activities.
Objectives
Sviluppo di uno strumento di gestione della riproduzione della mandria che si basi su informazioni genomiche e di utilizzo gratuito per la comunità degli allevatori. Lo strumento sviluppato prevede di rilasciare informazioni per: il controllo del livello di consanguineità genomica; la gestione della variabilità genetica; suggerire accoppiamenti programmati con tori selezionati in base alle informazioni genomiche. Lo strumento sarà complementare rispetto a quelli esistenti e modulare rispetto a strumenti futuri che lo potranno integrare. Disseminazione dei risultati agli allevatori attraverso azioni dimostrative e d’informazione.
Activities
The work plan involves the collection of samples and data in partner farms, their storage and the extraction of DNA for genotyping through SNP chips at 150K density. The genotypes will be subsequently analysed to obtain the parameters of inbreeding and genomic variability to be used for the management of herd reproduction. Finally, the production of the management tool and its dissemination through practical school sessions is foreseen, using the data of the partner farms’ for demonstration purposes
Activities
Il piano di lavoro prevede la raccolta di campioni e dati nelle aziende partner la loro archiviazione e l’estrazione di DNA per la genotipizzazione attraverso Chip SNP a 150K di densità. I genotipi saranno successivamente analizzati per ottenere i parametri di consanguineità e variabilità genomica per la gestione della riproduzione della mandria. Infine, è prevista la produzione dello strumento di gestione e la sua divulgazione attraverso le scuole di stalla, stalla utilizzando i dati delle aziende partner del progetto a scopo dimostrativo.
Kontext
The Regione Lombardia dairy cattle sector is a productive reality with a strong economic impact for the Italian trade balance: 43% of raw milk from the farm is, in fact, produced in this region, for a total value of more than 1.99 billion euros in the 2017.
The recent development of advanced technological genomic sequencing tools has made it possible to have direct information on the genotype of the animals under selection. The genomic selection of male reproducers proposed by Meuwissen et al. (2001) is now applied in livestock populations all over the world and is based on the use of differences in the sequence of the animal genome (Single Nucleotide Polymorphisms - SNPs, i.e. single point mutations).
Breeders use medium-low density genotyping panels (SNP-chips) to obtain the genomic value of their cows. SNP genotypes, however, can also be used very effectively for the control of inbreeding in the population and for the management of genetic variability in the herd.
The project therefore responds to a need of great importance for dairy cattle farmers: the control of inbreeding and the maintenance of genetic variability through the reproductive management of the herd with a tool based on genomic information.
Project details
- Main funding source
- Rural development 2014-2020 for Operational Groups
- Rural Development Programme
- 2014IT06RDRP007 Italy - Rural Development Programme (Regional) - Lombardia
Ort
- Main geographical location
- Milano
- Other geographical location
- Brescia, Mantova
€ 645799.96
Total budget
Total contributions from EAFRD, national co-financing, additional national financing and other financing.
Project keyword
1 Practice Abstracts
The project introduces a process and organizational innovation at farm level and at the animal breeding supply chain level. In fact, the production of genomic data and their use at farm level for the management of reproduction involves:
- introducing a new decision-making process in business management practices;
- develop a new organizational flow of data between companies / breeders associations / service providers to manage access to farmers and company genomic data according to rights and access to ownership;
- develop a data analysis process\ to maximize the return on economic investment by breeders and the national sector system.
L’idea progettuale introduce un’innovazione di processo e organizzativa sia a livello aziendale che a livello di filiera.
La produzione di dati di genotipizzazione e il loro utilizzo a livello aziendale per la gestione della riproduzione prevede infatti di:
- introdurre un nuovo processo decisionale nelle pratiche di gestione aziendale;
- sviluppare un nuovo flusso organizzativo di dati tra aziende/associazioni allevatori/fornitori di servizi per gestire l’accesso ai dati genomici aziendali secondo diritti e accesso alla proprietà degli stessi ;
- sviluppare un processo sovra-aziendale di analisi dati per massimizzare il ritorno dell’investimento economico da parte degli allevatori e del sistema nazionale del settore.
Contacts
Project coordinator
-
Università degli Studi di Milano, Dipartimento di Medicina Veterinaria - DIMEVET
Project coordinator
Project partners
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Associazione Regionale Allevatori Lombardia (ARAL)
Project partner
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Azienda Agricola Bertoletta di Zilocchi Omero e C.S.S
Project partner
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Azienda Agricola Bonetti
Project partner
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Azienda Agricola Chiappini Angelo
Project partner
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Azienda Agricola Fedeli Angelo Agostino e Marco
Project partner
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Benetti Giuseppe e Ambrogio Società Agricola
Project partner
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INSEME S.p.A.
Project partner
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Società Agricola Fenarola SS
Project partner