Le territoire visé dans ce projet présente des teneurs en nitrates dans les eaux souterraines et les cours d’eau particulièrement élevés. Cet excès de nitrates (indice de pollution d'origine agricole) est identifié comme responsable de l’eutrophisation de la baie du Mont Saint Michel. Cette teneur élevée se manifeste par une forte invasion des prés salés par le chiendent maritime, entrainant un enchainement de conséquences sur la chaîne alimentaire dans la baie, avec un impact sur les activités socio-économiques (AOP agneaux des prés-salés, conchyliculture, pêche, ainsi que de la valeur patrimoniale).

Ce projet vise donc la reconquête de la qualité de l’eau par l’optimisation des couverts « pièges à nitrates », la fertilisation et la valorisation de l’herbe par un accompagnement individuel des exploitants en leur fournissant une aide technico économique pour la transition de leur exploitation vers des pratiques agro écologiques, en raisonnant sur une approche globale des systèmes.