Practice Abstract - EIP-AGRI Operational Group

Scientific literature research: The scientific literature formed the basis for the implementation of the project. The available literature was continuously upda

Scientific literature research: The scientific literature formed the basis for the implementation of the project. The available literature was continuously updated over the course of the project. The increase in publications on Fusarium on garlic (+56% in the period 2019-2023; Scopus database, category "Agricultural sciences and biology") shows the increasing importance of the problem. At the start of the project, many reports were available on the first identifications of Fusarium proliferatum in particular as the causative agent of garlic rot. There were also reports of Fusarium oxysporum, a pathogen that causes significant damage to onions in particular. Soil and planting material were named as the source of the infestation. In more recent reports, F. proliferatum is described as a dry rot and F. oxysporum as a basal rot on garlic. Dry rot manifests itself in dry-appearing, beige to brown, spreading, sunken spots that can appear anywhere on the surface of the garlic cloves. The symptoms have mainly been documented on stored goods. Basal rot is a soft rot that extends upwards from the root side of the clove. In cases of severe infestation, the plants die in the field. Based on the literature data, a multiplex PCR was established with which both Fusarium species can be identified in one analysis. Further Fusarium species were identified by sequencing.

Wissenschaftliche Literaturrecherche: Die wissenschaftliche Literatur bildete die Grundlage für die Durchführung des Projektes. Die Fachliteratur wurde über der Projektlaufzeit fortlaufend aktualisiert. Der Anstieg der Publikationen zu Fusarium an Knoblauch (+56% im Zeitraum 2019-2023; Datenbank Scopus, Kategorie „Agrarwissenschaften und Biologie“) zeigt die zunehmende Bedeutung der Problematik. Zu Projektbeginn waren viele Berichte über die ersten Identifizierungen von vor allem Fusarium proliferatum als Erreger der Knoblauchfäule verfügbar. Daneben wurde auch über Fusarium oxysporum berichtet, ein Schaderreger, der v.a. an Zwiebel bedeutende Schäden verursacht. Boden und Pflanzgut wurden als Quelle des Befalls genannt. In den neueren Berichten wird F. proliferatum als Trockenfäule und F. oxysporum als Basalfäule an Knoblauch beschrieben. Die Trockenfäule äußert sich in trocken erscheinenden, beige bis braunen sich ausbreitenden einfallende Flecken, die überall an der Oberfläche der Knoblauchzehen auftreten können. Die Symptomatik wurde vorwiegend an Lagerware dokumentiert. Die Basalfäule gilt als weiche Fäule, die sich von der Wurzelseite der Zehe nach oben zieht. Bei einem starken Befall sterben die Pflanzen bereits im Feld ab. Aufbauend auf den Literaturdaten wurde eine multiplex PCR etabliert, mit der beide Fusarium Arten in einer Analyse identifiziert werden können. Weitere Fusarium-Arten wurden durch Sequenzieren identifiziert.

Source Project
Measures against soil-borne diseases in garlic growing in order to safeguard the cultivation in Austria
Completed | 2019-2023
Main funding source
Rural development 2014-2020 for Operational Groups
Geographical location
Austria
Project details